2012年，世界末日
这是我对X档案中外星人/阴谋论完整性的解释：被称之为黑油（Black Oil）的病毒，出现于几百万年前的地球。它可能已经进化了。很可能是通过流星或别的手段来到地球。有人认为它是行走于地球的第一个智能生物。这种病毒以类似于油的自然形式呈现，能进入异种生物体内并控制他们的身体。因此，这种病毒被认为肯定存在着感觉能力。另一类外星人，他们类似于人，也是很久以前到达地球，大约在35,000年前。显而易见黑油控制着部分或所有这种类型的外星人。他们中的一部分离开了地球，很可能是在这种病毒控制下离开的。而另一部分留在了地球，生存于各种秘密的地下位置，以休眠方式处于待激活状态。大量的黑油也积蓄在地下。这可能是因为在那时没有足够的人类维持黑油的殖民计划。
在数个世纪中，黑油外星人偶尔会绑架人类，充当实施行动的宿主，象为X迷所熟知的“赏金杀手”。例如大约在公元1300年，实质上除了几个老人外，外星人捕获了整个Anasazi人,那几个老人躲在含有磁铁矿的印弟安村庄中。显然外星人不能在那种地方生存。
现在，殖民军队的外星人主体力量正在返回，可能已经获得了增强。他们的高层代表与影子政府结盟合作达数十年。他们的目标就是控件整个人类的身体，产生一种奴隶。外星人所代表的力量可能类似于我们通常所说的“Grey Aliens”，这是在黑油病毒控制之下的形式。
美国情报机构首次了解这种外星人是在1947年的罗斯韦尔（Roswell），首次殖民计划是在1973。全世界许多国家政府的强权人物都意识到没有办法阻止外星殖民。作为缓兵之计他们成立了一个自己的组织并与外星人高层缔结盟约，协助外星人殖民计划，作为交换，外星人不会让这个联盟成员或家属被黑油感染。
通过外星人得到给影子政府的工具是一个计划——创造人类与外星人的杂合体，并且对黑油病毒具有免疫能力。一旦这种基因杂合人试验成功，影子正府成员将接受此基因治疗成为变种人。他们使用代码名为“纯种控制”（Purity Control）即此计划。在二战时从事人体实验不道德研究的德国及日本科学家被雇佣继续纯种控件工程项目。发展克隆技术及利用绑架者的基因材料是这项工程的全部。绑架者被通过他们身上的天花疫苗伤疤来识别跟踪。
由于某种原因，外星人不能或者不愿亲自管理DNA的研发工作。他们给影子政府提供科研信息和方向。监督由赏金杀手进行。对于人类而言很幸运，基因技术要求比二十世纪五十年代人类所掌握的技能要高很多。显然外星殖民者愿意等，也可能是因为有太多不成功的死亡案例。时间表上要求在2012年开始入侵计划，因此也给科技进步提供了充足的时间。
对外星人而言，显然他们缺乏征服地球的足够力量，只能等到2012年他们的殖民部队来到地球。他们与影子政府的合作允许他们控制操纵政府对他们存在的反应，从而抑制阻止殖民的力量。对外星人而言在政治上使用这样聪明的一招非常少见，但是记住他们已经研究占据人类有几千年了。他们很可能非常了解人类的心理。
至少对于某些影子政府而言，与外星人的合作是一种伪装——缓兵之计，这是为应对外星入侵开发出真正有效的防御措施赢得时间。在开发黑油病毒抗体疫苗上投入了大量资源和努力。如果这种疫苗开发成功，不仅保护人体免受黑油病毒入侵，而且也可以驱逐已经寄居人体的病毒。
然而外星人还有一个秘密计划。就是通过人体来孕育外星人（Grey aliens），这个过程将导致人类种族灭绝，因为这个过程将杀死宿主人体。Greys，用于杂交试验的外星DNA来源。显然这比智能病毒更可取。这可能是因为 Greys 拥有不被人类所掌握的力量，比如能够变形、强大的精神念力。许多人类被绑架做试验有些人被释放，另一些人被带到外星人的秘密基地，比如埋藏于南极冰下的飞船当中，转交给殖民者。影子政府可能认为这些被绑架者将被感染充当入侵部队，但事实是他们被作为宿主感染以孵化更多的外星人（Grey aliens），等孵化时间正好时才把他们冷冻。玉米和蜜蜂是这个计划的另一个组成部分，尽管他们的准确角色还不清楚。影子政府可能告诉外量殖民者携带病毒的蜜蜂可以感染人类，或者蜜蜂可以在传播花粉时将病毒植入其中。影子政府可能希望玉米（或者处理过的玉米油）能用于向世界各地传播病毒免疫疫苗。注意到蜜蜂并不对玉米授粉是令人感兴趣的；这个精心设计的骗局可能是影子政府用以误导外星殖民者。影子政府最初是作为一个情报运作、管理纯种控制的一个秘密地下联盟开始的。然而经过了很多年，它的力量和影响越来越强大，渗透于国际间各个方面。在1990年，他们停止让成员行动对任何一个政府负责。他们只服从自己内部结构的命令链。Conrad Strugholdt，一个德国工业家，离开他的祖国去了北非，成为公认的领袖。
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